Au démarrage du bac, en cas d'entretien peu régulier, de surpopulation, de mauvais éclairage ou de mauvaise pousse des plantes les algues peuvent se développer très vite. Il faut alors corriger la cause et traiter avec un antialgue. Attention à certains antialgues toxiques pour les invertébrés.

Des algues vertes sont souvent dues à trop de lumière ( soleil direct) alors que les brunes apparaissent souvent en cas d'éclairage trop vieux ou insuffisant.

Dans tous les cas, il y a aussi souvent trop de nitrate ou de phosphate ( excés d'alimentation, surpopulation...).